OBJETIVO Y ESTRUCTURA DE LOS MÓDULOS
El objetivo principal de la tarea a la que os enfrentáis es aprender y aplicar uno de los métodos usados por los científicos para detectar los elementos transponibles o elementos móviles (TE) candidatos a ser adaptativos. Es decir, detectar los TE que han hecho a Drosophila melanogaster más adaptada al ambiente en el que vive.
¿Por qué?
Porque con esta lista los científicos funcionales podrán buscar y probar en el laboratorio las posibles funciones de los genes cercanos a estos TEs y entender cómo y por qué están mejor adaptados al ambiente comparado con los individuos que no llevan está mutación.
Para ello, debéis aprender y familiarizaros con conceptos teóricos y herramientas prácticas que se van presentando en cada uno de los siguientes módulos. En algunos de ellos veréis que hay una sección “Ponte a Prueba” con el propósito de que vayáis cogiendo práctica en las diferentes etapas del proceso y poder completar, por lo tanto, la difícil tarea de distinguir o clasificar las mutaciones en función de su relevancia e interés, lo cual es uno de los mayores quebraderos de cabeza para los científicos que estudian la evolución hoy en día. Finalmente, os adjuntamos un Anexo 1 donde encontraréis un pequeño resumen sobre la información actual de TEs de Drosophila melanogaster candidatos a ser adaptativos.
ÍNDICE DE LOS MÓDULOS
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- ADN, genes y genoma
- Mutaciones
- TEs (elementos transponibles del genoma)
- Genética de poblaciones: aspectos a tener en cuenta (tipos de mutaciones según efecto, selección natural, frecuencias, recombinación)
- Drosophila melanogaster: la protagonista
- Módulo 2. Instalación de herramientas para trabajar
- ¿Por qué un paquete estadístico?
- Instalación de R
- Instalación de RStudio
- Archivo de código R
- Instalación de Editor de Texto
- Módulo 3: Visualizar los TEs y el archivo de datos: importar y distribución de variables
- FlyBase y Gbrowse
- ¿Qué contiene el archivo de datos?
- ¿Cómo importar el archivo de datos a R?
- Distribución de las variables de interés
- Ponte a prueba: PREGUNTAS
- Módulo 4. Generar listas de TEs candidatos a ser adaptativos
- Lista de TEs candidatos a ser adaptativos: PONTE A PRUEBA
- Cambiar parámetros: PONTE A PRUEBA
- Comprobar listas: PONTE A PRUEBA
Anexo 1: Información actual sobre TEs en Drosophila melanogaster candidatos a ser adaptativos
